支原體qpcr法檢測(cè):樣本的處理與DNA提取
支原體qPCR法檢測(cè)操作過程
本流程旨在通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)技術(shù),對(duì)樣本中的支原體(Mycoplasma)DNA進(jìn)行特異性擴(kuò)增與檢測(cè),以判斷樣本是否受到支原體污染。整個(gè)過程包括樣本處理、DNA提取、qPCR反應(yīng)體系配制、擴(kuò)增程序運(yùn)行及結(jié)果分析。
一、實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
實(shí)驗(yàn)室分區(qū)管理
遵循“三區(qū)原則”:樣本處理區(qū)、試劑準(zhǔn)備區(qū)、擴(kuò)增與產(chǎn)物分析區(qū),避免交叉污染。
各區(qū)域使用專用移液器、耗材和工作服。
試劑與儀器準(zhǔn)備
qPCR儀
離心機(jī)、渦旋振蕩器、微量移液器
支原體DNA提取試劑盒
支原體特異性qPCR檢測(cè)試劑盒(含引物、探針、dNTPs、Taq酶、緩沖液等)
無菌無酶PCR管、槍頭
陽性對(duì)照(支原體DNA)、陰性對(duì)照(無菌水)、內(nèi)參對(duì)照(如18SrRNA,用于檢測(cè)提取效率)
引物與探針設(shè)計(jì)(若使用自建體系)
靶基因:常用保守序列如16SrRNA基因或P1黏附蛋白基因。
探針標(biāo)記:通常為FAM熒光標(biāo)記,淬滅基團(tuán)為BHQ1或TAMRA。
二、樣本處理與DNA提取
樣本類型
細(xì)胞培養(yǎng)上清、血清、尿液、拭子樣本等。
DNA提取步驟(以液體樣本為例)
取1mL樣本,13,000rpm離心5分鐘,棄上清。
沉淀中加入裂解液(BufferATL)和蛋白酶K,56℃水浴孵育1小時(shí)。
加入乙醇,混勻后轉(zhuǎn)移至DNA純化柱。
依次用洗滌液(AW1、AW2)洗滌。
最后用50–100μL無酶水洗脫DNA,-20℃保存?zhèn)溆谩?/div>